Основой Fastra II является процессор Intel Core i7, работающий на частоте 2,66 гигагерца. Для повышения производительности используется семь видеокарт. Это шесть двухпроцессорных Nvidia GeForce GTX 295 и карта GeForce GTX 275 с одним графическим чипом.

Создатели Fastra II подчеркивают, что их вычислительный комплекс мощнее имеющихся в университете 512-ядерных кластеров. Использоваться этот суперкомпьютер будет, в основном, для томографии, обработки рентгеновских снимков и создания трехмерных изображений костей